Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ssxb1Q9CPU1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Ssxb1Q9CPU1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssxb1Q9CPU1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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