Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms