Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms