Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramel1Q99MW3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms