Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps4Q99KG7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms