Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp11Q99K46 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp11Q99K46 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp11Q99K46 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp11Q99K46 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp11Q99K46 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp11Q99K46 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp11Q99K46 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp11Q99K46 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp11Q99K46 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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