Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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