Protein–RNA interactions for Protein: Q99J62

Rfc4, Replication factor C subunit 4, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc4Q99J62 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rfc4Q99J62 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rfc4Q99J62 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rfc4Q99J62 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rfc4Q99J62 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rfc4Q99J62 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc4Q99J62 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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