Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csmd1Q923L3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms