Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim59Q922Y2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms