Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klc3Q91W40 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klc3Q91W40 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms