Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klhdc3Q8VEM9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klhdc3Q8VEM9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Klhdc3Q8VEM9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klhdc3Q8VEM9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klhdc3Q8VEM9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klhdc3Q8VEM9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klhdc3Q8VEM9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klhdc3Q8VEM9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klhdc3Q8VEM9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Klhdc3Q8VEM9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms