Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul7Q8VE73 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms