Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE47

Uba5, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba5Q8VE47 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba5Q8VE47 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba5Q8VE47 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba5Q8VE47 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba5Q8VE47 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba5Q8VE47 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uba5Q8VE47 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Uba5Q8VE47 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Uba5Q8VE47 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uba5Q8VE47 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms