Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms