Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms