Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cdk8Q8R3L8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cdk8Q8R3L8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cdk8Q8R3L8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cdk8Q8R3L8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cdk8Q8R3L8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cdk8Q8R3L8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cdk8Q8R3L8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cdk8Q8R3L8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cdk8Q8R3L8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cdk8Q8R3L8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cdk8Q8R3L8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cdk8Q8R3L8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk8Q8R3L8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms