Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms