Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms