Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gga1Q8R0H9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gga1Q8R0H9 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms