Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms