Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms