Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Casc3Q8K3W3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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