Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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