Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbsnQ8CIT9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms