Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE8

Fbxw17, F-box and WD-40 domain protein 17, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw17Q8CFE8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Fbxw17Q8CFE8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Fbxw17Q8CFE8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Fbxw17Q8CFE8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Fbxw17Q8CFE8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Fbxw17Q8CFE8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fbxw17Q8CFE8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms