Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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