Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms