Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms