Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfibp1Q8C8U0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms