Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp20Q8C6M1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp20Q8C6M1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp20Q8C6M1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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