Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf428Q8C1M2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms