Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Atcayos-201ENSMUST00000129834 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm12792-201ENSMUST00000117669 1019 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gpr33-201ENSMUST00000040161 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm8261-201ENSMUST00000119275 1208 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms