Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ctdsp2Q8BX07 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ctdsp2Q8BX07 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ctdsp2Q8BX07 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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