Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms