Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Pggt1bQ8BUY9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Pggt1bQ8BUY9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Pggt1bQ8BUY9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pggt1bQ8BUY9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pggt1bQ8BUY9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pggt1bQ8BUY9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pggt1bQ8BUY9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pggt1bQ8BUY9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pggt1bQ8BUY9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pggt1bQ8BUY9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms