Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpa1Q8BLA8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpa1Q8BLA8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpa1Q8BLA8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpa1Q8BLA8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpa1Q8BLA8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpa1Q8BLA8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpa1Q8BLA8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpa1Q8BLA8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpa1Q8BLA8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpa1Q8BLA8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpa1Q8BLA8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms