Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms