Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Smarcal1Q8BJL0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Smarcal1Q8BJL0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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