Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atg4bQ8BGE6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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