Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms