Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ttc28Q80XJ3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ttc28Q80XJ3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ttc28Q80XJ3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ttc28Q80XJ3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ttc28Q80XJ3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ttc28Q80XJ3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ttc28Q80XJ3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ttc28Q80XJ3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ttc28Q80XJ3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ttc28Q80XJ3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc28Q80XJ3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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