Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Zbed4Q80WQ9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Zbed4Q80WQ9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Zbed4Q80WQ9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Zbed4Q80WQ9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Zbed4Q80WQ9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed4Q80WQ9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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