Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrc2bQ7TPM1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrc2bQ7TPM1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrc2bQ7TPM1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrc2bQ7TPM1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrc2bQ7TPM1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrc2bQ7TPM1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrc2bQ7TPM1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrc2bQ7TPM1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrc2bQ7TPM1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrc2bQ7TPM1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrc2bQ7TPM1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms