Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Znf250Q7TNU6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms