Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sbno2Q7TNB8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms