Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ScocQ78YZ6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms