Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms