Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ubfd1Q78JW9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ubfd1Q78JW9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ubfd1Q78JW9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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