Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms